Ortodontik tedavi gören bireylerde , özellikle ağıza takılan aygıtlara alışma dönemi olan tedavi başlangıcında, aparey batmalarına-sürtmelerine bağlı tahrişler ve ağız yaralanmalarının görülmesi çok normaldir. Hastalar bu tür durumlardan en çok tedavinin başında şikayet ederler.  Oysa tedavinin ilerleyen dönemlerinde genellikle dudak ve yanaklar bu yeni yapılara adaptasyon göstermeye başlarlar ve başlangıçtaki kadar kolay tahriş ve yaralanma görülmez. Oluşabilecek yeni tahriş ve yaralanmalar da eskisine göre çok daha hızlı tolere edilir, çünkü ağzın savunma sistemi devreye girmiştir ve bu tarz sorunlara daha hızlı ve etkili cevap vermek için hazırdır.  Bu savunma sisteminin önemli bir kısmında bakterilerde rol alır. Bir diğer deyişle sağlıklı bir bakteri dengesine sahip ağız florasında bu tarz tahrişler ve yaralanmaların tolerasyonu çok çok daha rahat geçecektir. Probiyotik gargara ve ağız solüsyonlarının kullanımı bahsedilen bakteriyel dengenin hızlıca oluşmasında büyük önem taşırlar.